在这个过程中，达尔文还与一位年轻的植物学家约瑟夫·道尔顿·胡克建立了联系。胡克对达尔文的植物样本进行了详细的分类和研究，他的发现进一步支持了达尔文的观点。胡克惊奇地发现，这些岛屿上的植物物种丰富度远超他的预期，几乎一半的植物是岛屿特有的，而且几乎每一种开花植物和蕨类植物都只分布于特定的岛屿。这一发现使得物种由一个中心辐射开去的传统观念受到了挑战。

达尔文和胡克的研究不仅揭示了加拉帕戈斯群岛植物的独特性，也提供了关于植物如何到达并在岛屿上生存的有趣猜测。胡克提出了几种可能的途径，包括洋流、气流、鸟类和人类的传播。这些假设后来被达尔文通过种子实验得到了部分验证，他发现许多种子可以在海水中生存数周，甚至数月，从而有可能从大陆漂流到偏远的岛屿。

这些研究成果使达尔文得出了一个重要结论：物种是可以变化的，它们能够适应新的环境，并且通过自然选择的过程，最适应环境的变种会存活下来，从而可能形成新的物种。这一理论的提出，彻底改变了人类对生物世界的理解，为生物多样性的研究奠定了基础。

达尔文的进化论并不是一蹴而就的，而是基于对加拉帕戈斯群岛植物的仔细观察和深入研究。这些植物不仅证实了物种的变异性和适应性，也为达尔文构建进化论提供了坚实的实证基础。加拉帕戈斯群岛上的植物，尤其是它们独特的分布和适应策略，成为了进化论的一个重要灵感来源。