最早人们发现幽灵船是在二战时期，那个时候美日海上交战，有一艘神秘的小军舰时隐时现的跟在后面，美军还以为是日本的船只呢，一旦靠近又神秘得消失了，水面连波纹也没有。

后来，有士兵落水，神秘船又出现，还用神奇的海浪救了这些士兵，但有士兵想追上去表示谢意的时候，幽灵船又消失在海面上。后来各路探险家不畏凶险想探索其中的奥秘，去寻找幽灵船，但都无一所获，因此，幽灵船就像它的名字一样，笼罩上了神秘的面纱。

幽灵船表现善良的一面，救落水的士兵，但它也有恶的一面，我们听说过的泰坦尼克号当年的沉船事件，最初人们都以为是触礁而沉，但过了很多年以后，有专家从新对此事件调查发现，泰坦尼克号的撞击部位呈现非常规则的圆形，就像是被人用激光武器打穿的。而且不年的幸存者后来也回忆说，泰坦尼克号沉没后，船的四周出现了幽灵船，这会不会是幽灵船所为呢？

不管幽灵船到底是什么，美国科学家表示，这绝对不是地球目前的科技可以制造出来的，地球上没有任何一个可以制造出如此完美神出鬼没的军舰，它所去用的技术至少超越现代科技300年。也有学者提出，幽灵船或许并非地球人类，而是来自于地外文明，是宇宙的外星人建造的。